דין משעתי הינו הליך משמעתי שבו דן המפקד חייל הכפוף לו, בהתאם לתלונה המוגשת בדרך כלל על ידי גורם בסגל הפיקודי ביחידה. לעומת זאת, בבית דין צבאי, נדונים כתבי אישום המוגשים על ידי תובע צבאי (שאינו חלק מהיחידה של החייל).
הבדל נוסף בין הליך משמעתי להליך בבית דין צבאי הוא בסמכות הענישה, כך שסמכות הענישה של בית הדין רחבה הרבה יותר והרשעה גוררת לעתים גם רישום פלילי. בדין משמעתי אין רישום פלילי והעבירה נרשמת רק בגיליון ההתנהגות של החייל.