כל מי שנשפט בבית דין צבאי או בבית המשפט הצבאי שפעל בלוד, יכול ורשאי לפנות לנשיא המדינה ולבקש כי תבחן בקשתו להתערבות הנשיא בעניינו – בין אם על דרך של הקלה בעונש, בין אם על דרך של קיצור תקופת מחיקת הרשעתו ובין אם על דרך של חנינה מלאה.את הבקשה יש לשלוח ללשכת נשיא המדינה, רח' הנשיא 3, ירושלים.  ובמקביל יש להעביר העתק מן הבקשה למדור חנינות בפרקליטות הצבאית, ביה"ס למשפט צבאי, מדור חנינות, ד.צ 03608, צה"ל.

על הבקשה להיות חתומה ולכלול את הפרטים הבאים: שם מלא, מספר תעודת זהות, מספר אישי, כתובת וטלפון, מספר ההליך הפלילי ומקום השיפוט, סוג העבירה, תיאור הנסיבות, העונש שהוטל והטעמים לבקשה. בין הטעמים ניתן למנות שירות צבאי תקין (רצוי לתמוך זאת בהמלצות מפקדים, תעודות הצטיינות או תעודות המעידות על הישגים מיוחדים וצבא ובאזרחות), נסיבות אישיות מיוחדות, תרומה לחברה וסיבות חדשות, אם ישנן, מאז ההרשעה.  יש לצרף לבקשה מסמכים התומכים בטענות, והמאמתים את האמור בנימוקי הבקשה.

לאחר שהתקבלה בקשת החנינה בבית הנשיא, והועברה לטיפול מדור חנינות, פונה מדור חנינות לגורמים שונים הנוגעים בדבר על מנת לקבל מהם מידע או חוות דעת, הדרושים לצורך גיבוש ההמלצה. בתום איסוף כל המידע הדרוש, נכתבת חוות דעתו של הפרקליט הצבאי הראשי או סגנו לגבי הבקשה, וזו מועברת לעיונם ולחוות דעתם של ראש אכ"א, הרמטכ"ל ושר הביטחון. חוות דעתו של שר הביטחון עוברת לנשיא המדינה למתן החלטתו, והחלטת הנשיא נמסרת ישירות למבקש. הטיפול בחנינה הינו תהליך ממושך, לאור מורכבותו וריבוי הגורמים הנוטלים בו חלק.

ככלל, כל מקרה ישקל ויבחן בהתאם לנסיבותיו, בשים לב, בין היתר, לטיב העבירה וחומרתה, עבר פלילי, השירות הצבאי בסדיר ובמילואים, נסיבותיו האישיות של המבקש, חלוף הזמן ונסיבות חדשות מאז ההרשעה והבעת חרטה.