מתקני ומחנות הצבא מוקמים בהתאם להסדר מיוחד הקבוע בחוק התכנון והבניה בנוגע להקמת "מתקנים ביטחוניים". הסדר זה מבכר את האינטרס הביטחוני על פני אינטרסים תכנוניים אחרים.
בשני פסקי דין שניתנו על ידי בית המשפט העליון בשנת 2007, הבהיר בית המשפט העליון כי לצד חשיבותו של האינטרס הביטחוני יש מקום לאזנו עם אינטרסים תכנוניים אחרים, בדגש על נושאים סביבתיים, בעת הקמת מתקנים ביטחוניים חדשים.
הפרקליטות הצבאית מסייעת לגורמי צה"ל בניתוח השלכותיה הרחבות של פסיקת בית המשפט העליון, בגיבוש נהלי עבודה חדשים וביישום העקרונות שנקבעו בפסיקה בחיי המעשה, בעת הקמתם של מתקנים ביטחוניים חדשים.